Petite fille poisson, Ponyo, décide de partir à la découverte du monde et quitte la demeure sous-marine de son père, le sorcier Fujimoto. Emportée par le courant, elle s'échoue sur une plage où Sôsuke, un petit garçon de cinq ans qui habite la maison sur falaise, la découvre. Il décide de la garder et de la protéger. Subjugué par Sôsuke et l'univers elle découvre, Ponyo ne se doute pas des forces qu'elle vient de réveiller par son seul souhait de rejoindre le monde des hommes.

Gake no Ue no Ponyo (Ponyo sur la falaise) sort en 2009. Avec ce conte, Miyazaki retrouve la simplicité de ces premiers films, leur tendresse et leur poésie.